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张文彬课题组发展异质缠结基元实现蛋白质高阶索烃及人工抗体的生物合成

 

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拓扑是链式大分子重要结构属性。变化拓扑结构也是调控大分子性质和功能的常用手段。近年来,具有结和链环等非线性化学拓扑结构的蛋白质被陆续发现,其研究揭示了拓扑结构可能会给蛋白质带来稳定化作用。工业酶、蛋白质药物等研发改性提供了崭新的思路。基于组装-反应协同的思想,人们利用可基因编码的蛋白质缠结基元和反应基元,已经实现不同拓扑蛋白的高效生物合成并意识到这些基元对于发展蛋白质拓扑工程至关重要目前,尽管可基因编码的蛋白质偶联工具已经获得了极大的丰富与发展,高效可控的蛋白质缠结基元却相对缺乏,大大限制了复杂拓扑结构的合成。最近,张文彬课题组对经典的p53dim蛋白质同质缠结基元进行工程化,发展了高效特异的蛋白质异质缠结二聚体,实现了包括蛋白质高阶索烃的生物合成,并初步探索了在人工抗体领域的应用

 

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p53dim是源肿瘤抑制蛋白p53的一个同质二聚缠结基元。在该工作中,研究者二聚界面通过突变引入带电残基,利用静电作用同类相斥、异类相吸的特点,使同质二聚体变得不稳定,得到一对异质二聚p53dim缠结基元:X+T5R/Q7R)和X-T5E/Q7E)(其中T为苏氨酸,Q为谷氨酰胺,R为精氨酸,E为谷氨酸)。该基元可在细胞内选择性诱导两条不同蛋白质链缠结组装,结合彼此正交分离内含肽介导的偶联关环反应,就可制备含有不同目标蛋白蛋白质异质索烃而通过分别表达含有2个或3个串联X-基元大环蛋白骨架和与之缠结组装的含有1X+基元的小环蛋白基元,结合彼此严格正交的分离型内含肽主链偶联反应和谍标签-谍捕手侧链偶联反应进一步在细胞内原位实现蛋白质[3]索烃和[4]索烃的高效合成。该体系通过基因编码环内插入多种不同结构的目标蛋白人表皮生长因子受体2亲和体AffiHER2折叠绿色荧光蛋白sfGFP),为构建兼具多价性稳定性的功能蛋白提供了优良的结构骨架此类含有AffiHER2高阶蛋白质索烃可被看成多价的人工抗体类似物因此命名为[n]索烃抗体[3]catbody[4]catbody)。[n]索烃抗体展示了比野生型AffiHER2更高的亲和力和稳定性例如,[4]索烃抗体的亲和力提升了约8,而其在小鼠体内的半衰期也从前体的~0.5小时延长到了~5.1小时,并可在肿瘤处实现富集。工作使复杂高阶索烃的生物合成成为可能,揭示在蛋白质药物开发中富具前景

 

该研究近期在线发表于Journal of the American Chemical Society。澳门新葡萄京官网注册博士文豪为该论文第一作者北京大学澳门新葡萄京官网注册张文彬教授中国科学院过程工程研究所魏炜研究员为论文共同通讯作者。该工作得到了北京分子科学国家研究中心,科技部国家重点研发计划、国家自然科学基金、北京市自然科学基金、北京大学临床医学+X青年专项、生化工程国家重点实验室开放基金以及中国博士后科学基金的资助。

 

原文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.1c06169

 

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